世界清真食品理事会（WHFC）诞生于对食品、药品和化妆品的评估研究所的一个概念想法。现如今世界上有许多HALAL组织，印尼乌里玛理事会（LPPOM MUI）想把这些组织结合在一起，相互认识并能够一起工作。

1999年在希尔顿大酒店的聚会上，印尼乌里玛理事会LPPOM MUI成立世界清真食品理事会（WHFC）并选择HJ.Aisjah Girindra教授担任第一任理事长，同时任命来自美国的Mohamed  Sadek博士为副理事长，来自澳大利亚的Ali Chawk先生为秘书长和来自荷兰的A. Al Chaman为财务管理人。WHFC的任务是规范屠宰行业、食品加工行业和香料行业的清真标准。

多年以来，世界清真食品理事会的名字发生了变化—最终“食品”二字被删除，新的名字出现–世界清真理事会。2007年，Ir. H.M. Nadratuzzaman Hosen博士接替HJ.Aisjah Girindra教授担任理事长职位并任职到2009年，接着2010年，lukmanul Hakim, M.Si博士被选为世界清真理事会新主席。

在2011年6月23日，全球超过21个认证机构在雅加达的毕达咖拉酒店举行了两天的会议，并经过长时间的审议，重新采用原来的愿景，目标和1999个组织的名称。

与会代表一致同意：

a. 重新使用世界清真食品协会WHFC名称

b. 选举印尼乌里玛理事会（LPPOM MUI）的董事Dr. Lukmanul Hakim, M. Si为WHFC的新理事长。

c. 在印尼注册。

d. 在雅加达成立永久总部。

e. WHFC还重申了该组织的目的是维护清真Halal法规的实现, 维护组织的团结,并实现一个独立的全球标准。